蛋白質(zhì)通過(guò)鹽析的辦法沉淀的原理是降低蛋白質(zhì)的溶解度，使蛋白質(zhì)凝聚而從溶液中析出。影響鹽析的若干因素：
1．蛋白質(zhì)濃度
高濃度蛋白溶液可以節約鹽的用量，但許多蛋白質(zhì)的b 和Ks常數十分接近，若蛋白濃度過(guò)高，會(huì )發(fā)生嚴重的共沉淀作用；在低濃度蛋白質(zhì)溶液中鹽析，所用的鹽量較多，而共沉淀作用比較少，因此需要在兩者之間進(jìn)行適當選擇。用于分步分離提純時(shí)，寧可選擇稀一些的蛋白質(zhì)溶液，多加一點(diǎn)中性鹽，使共沉淀作用減至低限度。一般認為2.5%-3.0%的蛋白質(zhì)濃度比較適中。
2．離子強度和類(lèi)型
一般說(shuō)來(lái)，離子強度越大，蛋白質(zhì)的溶解度越低。在進(jìn)行分離的時(shí)候，一般從低離子強度到高離子強度順次進(jìn)行。每一組分被鹽析出來(lái)后，經(jīng)過(guò)過(guò)濾或冷凍離心收集，再在溶液中逐漸提高中性鹽的飽和度，使另一種蛋白質(zhì)組分鹽析出來(lái)。
離子種類(lèi)對蛋白質(zhì)溶解度也有一定影響，離子半徑小而很高電荷的離子在鹽析方面影響較強，離子半徑大而低電荷的離子的影響較弱，下面為幾種鹽的鹽析能力的排列次序：磷酸鉀>硫酸鈉>磷酸銨>檸檬酸鈉>硫酸鎂。
3．PH值
一般來(lái)說(shuō)，蛋白質(zhì)所帶凈電荷越多溶解度越大，凈電荷越少溶解度越小，在等電點(diǎn)時(shí)蛋白質(zhì)溶解度小。為提高鹽析效率，多將溶液PH值調到目的蛋白的等電點(diǎn)處。 但必須注意在水中或稀鹽液中的蛋白質(zhì)等電點(diǎn)與高鹽濃度下所測的結果是不同的，需根據實(shí)際情況調整溶液PH值，以達到*好的鹽析效果。
4．溫度
在低離子強度或純水中，蛋白質(zhì)溶解度在一定范圍內隨溫度增加而增加。但在高濃度下，蛋白質(zhì)、酶和多肽類(lèi)物質(zhì)的溶解度隨溫度上升而下降。在一般情況下，蛋白質(zhì)對鹽析溫度無(wú)特殊要求，可在室溫下進(jìn)行，只有某些對溫度比較敏感的酶要求在0-4℃進(jìn)行。