RNA和DNA提取實(shí)驗中的問(wèn)題分析:
1.產(chǎn)量低
如果您遇到的 DNA/RNA 產(chǎn)量低于您對樣品的預期,則需要考慮許多因素。通常,這是一個(gè)裂解問(wèn)題。不完全裂解是產(chǎn)量低的主要原因。它也可能是由不正確的綁定條件引起的。確保使用新鮮的優(yōu) 質(zhì)乙醇(100% 200 標準)稀釋緩沖液或添加到結合的步驟。劣質(zhì)乙醇或舊庫存可能已經(jīng)吸收了水分,并且濃度不正確。如果洗滌緩沖液制備不正確,您可能正在洗掉提取的 DNA 或 RNA。
2.低純度
如果提取的 DNA 被蛋白質(zhì)污染(低 260/280),那么您可能開(kāi)始時(shí)樣品過(guò)多,而蛋白質(zhì)沒(méi)有完全去除或溶解。
如果 DNA 的 260/230 比率不佳,則問(wèn)題通常是結合或洗滌緩沖液中的鹽分。確保使用高質(zhì)量的乙醇來(lái)制備洗滌緩沖液,如果問(wèn)題仍然存在,請再次洗滌色譜柱。
與其他樣品相比,一些樣品含有更多的抑制劑。環(huán)境樣品特別容易出現純度問(wèn)題,因為腐殖質(zhì)在提取過(guò)程中會(huì )被溶解。
腐殖質(zhì)的行為與 DNA 相似,很難從硅膠柱中去除。
3.降解
降解問(wèn)題是RNA制備中常常到的問(wèn)題。因為在 RNA 提取過(guò)程中,樣品儲存不當或裂解效率低等情況都會(huì )導致降解。對于 DNA 提取,降解不是一個(gè)大問(wèn)題,因為對于 PCR,DNA 可以被剪切并且工作正常,如果不希望有較多剪切的 DNA,可以使用弱裂解的方法。